El año 2008, se organiza el III Encuentro Departamental de Semilleros, teniendo como sede la Universidad del Sinú, este evento se caracteriza por la alta participación de proyectos en varias categorías, su excelente organización y la entrega por primera vez de menciones de honor a los proyectos mejor evaluados de cada Institución, fortalecen el evento. Se realizan talleres y charlas sobre semilleros de investigación a los docentes y estudiantes de las Instituciones pertenecientes al Nodo. Se integran al Nodo Córdoba las Instituciones: Fundación Universitaria San Martín y la CUN sede Montería.
El XI Encuentro Nacional de Semilleros de Investigación versión 2008, es organizado por la Universidad EAFIT sede Medellín, en este evento el nodo Córdoba participa logrando destacarse como el nodo con más asistentes del país y la Universidad de Córdoba obtiene los mejores resultados de evaluación en diferentes áreas a nivel de ponencias y posters. Para este año, se realiza el relevo de coordinación del nodo y esta es asumida por Carlos Mario Araujo, representante de la Universidad Pontificia Bolivariana.
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